2026年8月末に令和9年度(2027年度)の概算要求が出そろい、GX(グリーントランスフォーメーション)関連予算は経済産業省・環境省の合計で過去最大規模となりました。GX経済移行債を財源とする「GX推進対策費」は、経産省1兆2,594億円、環境省2,750億円の合計1兆5,344億円。令和8年度当初予算(経産省6,050億円、環境省561億円)と比べて2.3倍、令和7年度補正(経産省3,572億円、環境省2,185億円)を足した金額と比べても大幅な増額です。

今回の概算要求は「補正予算依存からの脱却」を政府方針として掲げ、これまで年末の補正予算で手当てされてきたGX補助金が当初予算に一本化されています。省エネ補助金、クリーンエネルギー自動車補助金、断熱窓改修、商用車電動化など、事業者・個人が直接使う制度の多くが当初予算に載ったことで、公募の年間サイクルが変わる可能性があります。本記事では、経産省・環境省の一次資料をもとに、GX関連の予算と補助金を事業単位まで分解して整理します。

令和9年度概算要求におけるGX予算の全体像

経済産業省の令和9年度概算要求は総額7兆7,859億円で、令和8年度当初予算3兆693億円の約2.5倍です。増加の大半は新設された「強く豊かな日本」投資枠6兆3,116億円によるもので、GX推進対策費はこの投資枠の中に位置づけられています。

区分令和9年度概算要求令和8年度当初令和7年度補正
経済産業省 合計7兆7,859億円3兆693億円2兆2,009億円
「強く豊かな日本」投資枠6兆3,116億円4兆5,250億円(相当)
うちGX推進対策費(AI・半導体フレーム除く)1兆2,594億円6,050億円3,572億円
エネルギー対策特別会計 合計2兆6,351億円2兆5,333億円7,098億円
うちエネルギー需給勘定(GX・AI半導体除く)5,149億円4,420億円1,001億円
政策分野「資源エネルギー・GX」1兆9,838億円1兆2,107億円4,573億円

環境省は総額1兆1,451億円+事項要求を要求し、このうちエネルギー対策特別会計を活用した温室効果ガス削減施策が5,151億円です。令和8年度当初2,059億円から2.5倍に拡大し、GX推進対策費は561億円から2,750億円へ約5倍となりました。

区分令和9年度概算要求令和8年度当初令和7年度補正
環境省 合計1兆1,451億円+事項要求
エネルギー対策特別会計(温室効果ガス削減施策)5,151億円2,059億円2,801億円
うちGX推進対策費2,750億円561億円2,185億円
第一の柱 地域・くらしの創造3,131億円643億円2,362億円
第二の柱 バリューチェーン・サプライチェーンの脱炭素移行1,606億円1,013億円440億円
第三の柱 先導技術実証・情報基盤整備235億円219億円
第四の柱 国際展開・国際貢献174億円178億円
経産省と環境省のGX推進対策費を合算すると1兆5,344億円。令和8年度当初の合計6,611億円から8,733億円の増額で、GX経済移行債20兆円(2023〜2032年度)の執行ペースが明確に上がる要求内容です。

GX推進対策費とは何か

GX推進対策費は、GX経済移行債を財源として、産業競争力強化・経済成長・排出削減効果が高い脱炭素関連事業に充てる予算枠です。GX経済移行債は2024年2月に初めて発行され、10年間で20兆円規模の先行投資を行い、その償還財源として2026年度からの排出量取引制度(GX-ETS)と2028年度からの化石燃料賦課金を充てる設計です。

企業側から見ると、GX推進対策費で措置される補助金は「先行投資の呼び水」であり、その裏側で炭素コストが段階的に顕在化していく構造です。補助金を受け取る側にも、GX-ETSやカーボンプライシングへの対応が前提になる制度設計が進んでいます。

GX政策の制度スケジュール

時期制度・イベント企業への影響
2024年2月GX経済移行債の初回発行20兆円規模の先行投資が本格化
2025年5月改正GX推進法成立排出量取引への参加義務化を法制化
2026年4月改正GX推進法施行、GX-ETS第2フェーズ開始年間CO2排出量10万トン以上の事業者は参加義務。2026年度は排出量の算定期間
2027年度2026年度実績に基づく最初の排出枠割当割当を超過した排出分は排出枠の調達が必要。排出量取引市場が本格稼働
2028年度化石燃料賦課金の導入化石燃料の輸入・採取事業者に課金。エネルギーコストとして転嫁される
2029年度以降大規模事業所の排出量検証水準の段階的強化年間100万トン以上を目安に「合理的水準の確認」
2033年度発電部門への排出枠有償オークション導入電力コストへの影響が本格化
2050年度カーボンニュートラル達成、GX経済移行債償還完了

中小企業は原則としてGX-ETSの直接の対象外ですが、参加義務を負う大企業がScope3削減のために取引先へ省CO2化を求める動きは既に始まっています。環境省が「Scope3排出量削減のための企業間連携による省CO2設備投資促進事業」を令和8年度15億円から37億円へ2.5倍に増額したのは、この構造を制度側から後押しするものです。

経済産業省 GX経済移行債による投資促進策の全事業

経産省の概算要求概要「別紙3」に掲載されたGX経済移行債関連事業の全件です。合計はGX推進対策費1兆2,594億円に対応します。

事業名令和9年度要求令和8年度当初令和7年度補正内容
省エネルギー・非化石転換の投資促進・社会実装支援事業2,108億円840億円550億円工場・事業場の省エネ設備更新、電化・燃料転換、GX設備単位型、エネマネ導入。中小企業向け補助率が最も手厚い
次世代革新炉の技術開発・産業基盤強化支援事業1,411億円1,220億円60億円高温ガス炉・高速炉等の技術開発、サプライチェーン強化
GXサプライチェーン構築支援事業1,134億円497億円55億円蓄電池、水電解装置、ペロブスカイト太陽電池、浮体式洋上風力等の国内製造基盤
クリーンエネルギー自動車導入促進補助金1,100億円1,100億円EV・PHEV・FCVの購入補助。補正から当初へ移行
排出削減が困難な産業におけるエネルギー・製造プロセス転換支援事業881億円417億円鉄鋼・化学・セメント・紙パルプ等の製造プロセス転換
持続可能な航空燃料(SAF)の製造・供給体制構築支援事業700億円100億円国産SAF製造設備・供給インフラ。7倍増
水素等のサプライチェーン構築のための価格差に着目した支援事業655億円363億円低炭素水素・アンモニアと既存燃料との価格差を15年間支援
高効率給湯器導入促進による家庭部門の省エネルギー推進事業費補助金530億円570億円給湯省エネ事業。エコキュート、ハイブリッド給湯機、エネファーム
クリーンエネルギー自動車の普及促進に向けた充電・充てん設備等導入促進事業426億円500億円充電器、水素ステーション、V2H設備
次期航空機開発等支援事業400億円150億円脱炭素化に対応した次世代航空機の開発
再生可能エネルギー導入拡大に向けた系統用蓄電池等の電力貯蔵システム導入支援事業399億円350億円80億円系統用蓄電池、揚水発電等
フュージョンエネルギー発電実証推進事業326億円200億円核融合発電の実証
IPA信用基金への出資(次世代半導体事業者への債務保証)320億円―(新規)GX・AI半導体フレーム共通
低炭素水素等拠点整備支援事業275億円415億円水素等の受入・貯蔵・供給拠点整備
脱炭素電源地域貢献型投資促進事業260億円400億円地域と共生する脱炭素電源への投資
自律型資源循環システム強靭化促進事業137億円73億円環境省連携。資源循環設備
GX分野のディープテック・スタートアップ支援事業100億円185億円GXスタートアップの実証・量産投資
GX需要創出・カーボンプライシング運営事業72億円50億円GX-ETS運営、GX製品市場創出
脱炭素成長型経済構造移行推進機構(GX推進機構)出資金70億円200億円450億円債務保証・出資による民間GX投資支援
コンビナート等再生型共用インフラ等整備支援事業37億円30億円コンビナートの共用インフラ再構築
小型エンジンMRO拠点強化支援事業14億円7億円航空機エンジン整備拠点

経済産業省 エネルギー対策特別会計のGX関連事業

GX推進対策費とは別に、エネルギー需給勘定で措置される再エネ・水素・CCS等の事業です。「資源エネルギー・GX」分野1兆9,838億円のうち投資枠外の8,412億円がこれに当たります。

事業名令和9年度要求令和8年度当初令和7年度補正
電源立地地域対策交付金842億円794億円
石油天然ガス田の探鉱・資産買収等事業に対する出資金604億円427億円197億円
大規模系統整備等事業(新規)368億円
国内石油天然ガスに係る地質調査・メタンハイドレート研究開発等270億円252億円
洋上風力発電の導入促進に向けた採算性分析のための基礎調査事業153億円122億円
原油供給源多角化促進事業(新規)150億円
地熱発電の資源量調査・理解促進事業132億円126億円12億円
SSネットワーク維持・強化支援事業費補助金120億円160億円
先進的CCS支援及び国内外での貯留適地調査事業101億円8.7億円339億円
再エネ導入拡大に向けた分散型エネルギーリソース導入支援等事業101億円3.7億円81億円
競争的な水素等サプライチェーン構築に向けた技術開発事業78億円78億円
カーボンリサイクル・次世代火力発電の技術開発等事業70億円71億円
次世代燃料の生産・利用技術開発等事業61億円34億円
福島県における再エネ等の導入促進のための支援事業費補助金52億円52億円
災害時に備えた社会的重要インフラへの自衛的な燃料備蓄の推進事業費補助金41億円49億円8.2億円
再エネ主力電源化へ向けた太陽光発電の課題解決のための技術開発事業32億円31億円

分散型エネルギーリソース導入支援が3.7億円から101億円へ27倍に増えている点は注目に値します。家庭用・業務用蓄電池、V2H、需要側リソースのアグリゲーションなど、需要家側の設備投資を対象とする事業であり、中小企業・小規模事業者が使える可能性のある枠です。

環境省 GX関連事業の全体像

第一の柱 脱炭素でレジリエントかつ快適な地域・くらしの創造(3,131億円)

事業名令和9年度要求令和8年度当初令和7年度補正対象・内容
断熱窓への改修促進等による住宅の省エネ・省CO2加速化支援事業【GX】980億円1,125億円既築住宅の高断熱窓・ドア改修。先進的窓リノベの後継枠として当初予算化
脱炭素志向型住宅の導入支援事業【GX】500億円750億円GX志向型住宅(ZEH水準を超える新築)の導入
ペロブスカイト太陽電池の社会実装モデルの創出に向けた導入支援事業【GX】280億円70億円自治体・民間事業者の建物屋根・窓・インフラ空間へのフィルム型ペロブスカイト導入。4倍増
住宅の脱炭素化促進事業125億円80億円戸建ZEH、集合住宅の省CO2化
建築物等のZEB化・省CO2化普及加速事業115億円67億円業務用建築物のZEB化。うち業務用建築物の脱炭素改修加速化事業【GX】67億円(前年40億円)
特定地域脱炭素移行加速化交付金【GX】80億円70億円脱炭素先行地域等への交付金
データセンター等デジタル基盤の脱炭素化支援事業46億円13億円20億円データセンターの省エネ・再エネ導入
「デコ活」による脱炭素社会実装事業18億円16億円2億円国民運動、製品・サービスの社会実装
地域資源を活用したレジリエントなエネルギー循環・経済成長促進事業(新規)10億円防災・レジリエンス、国内資源活用、地域経済活性化の3モデル

第二の柱 バリューチェーン・サプライチェーン全体の脱炭素移行の促進(1,606億円)

事業名令和9年度要求令和8年度当初令和7年度補正対象・内容
商用車等の電動化促進事業【GX】300億円300億円EV・FCVトラック、EV・FCVバス、EV・PHEV・FCVタクシー、GX建機と一体的な充電設備
ゼロエミッション船等の建造促進事業【GX】248億円149億円10億円エンジン・燃料タンク・燃料供給システム等の生産設備
先進的な資源循環投資促進事業【GX】201億円200億円リチウム蓄電池からの再生材精製設備等
循環資源の安定供給のための高効率・高度化設備導入等促進事業103億円73億円30億円プラスチック・金属等のリサイクル設備
脱炭素技術等による工場・事業場の省CO2化加速事業(SHIFT事業)77億円58億円35億円CO2削減計画策定支援、省CO2設備更新。中小企業の利用実績が多い
脱炭素型循環経済システム構築促進事業77億円36億円1億円資源循環の実証
コールドチェーンを支える冷凍冷蔵機器の脱フロン・脱炭素化推進事業70億円70億円食品製造・倉庫・小売の自然冷媒機器導入
Scope3排出量削減のための企業間連携による省CO2設備投資促進事業【GX】37億円15億円代表企業がScope3目標を設定し、連携企業(取引先)の省CO2設備を支援
ゼロエミッション船等の導入支援事業【GX】27億円12億円船舶の導入
中小企業を含むバリューチェーン全体の脱炭素経営高度化事業17億円17億円中小企業の脱炭素経営、SBT・RE100等の支援

第三の柱・第四の柱(合計409億円)

事業名令和9年度要求令和8年度当初
脱炭素移行に向けた二国間クレジット制度(JCM)促進事業129億円139億円
地域共創・セクター横断型カーボンニュートラル技術開発・実証事業50億円50億円
革新的な省CO2実現のための部材や素材の社会実装・普及展開加速化事業37億円37億円
地域における再エネ等由来水素利活用促進事業33億円31億円
人工光合成を始めとしたCCUS社会実装・基盤構築事業26億円26億円
温室効果ガス観測技術衛星等による排出量検証に向けた技術高度化事業23億円22億円
地域資源循環を通じた脱炭素化に向けた革新的触媒技術の開発・実証事業19億円19億円
アジア等国際的な脱炭素移行支援のための基盤整備事業14億円14億円
2050年ネット・ゼロの実現に向けたインベントリ整備等調査費12億円12億円
地域共生型潮流発電事業モデル構築事業5億円5億円

中小企業が実際に使えるGX補助金

上記の事業のうち、中小企業・小規模事業者が申請主体になり得る制度を実務目線で絞り込むと、次の表になります。要求額は事業全体の額であり、中小企業枠の額ではありません。

補助金・事業所管令和9年度要求対象となる投資中小企業向けの補助率(令和8年度公募実績)
省エネ・非化石転換補助金(省エネルギー投資促進・需要構造転換支援事業費補助金)経産省2,108億円高効率空調・ボイラー・工作機械・変圧器・LED・産業ヒートポンプ等の更新、電化・燃料転換、EMS導入工場・事業場型 先進枠2/3、一般枠・中小企業投資促進枠1/2。設備単位型 従来枠1/3、GX設備単位型トップ性能枠1/2(更新)
クリーンエネルギー自動車導入促進補助金経産省1,100億円社用車のEV・PHEV・FCV化車種別定額。メーカーの充電インフラ・重要鉱物確保等の取組を総合評価して補助額を決定する方式に見直し。高額車種の補助抑制は継続
充電・充てん設備等導入促進事業経産省426億円事業所・商業施設の充電器、V2H設備費・工事費の定率補助
分散型エネルギーリソース導入支援等事業経産省101億円業務用蓄電池、V2H、需要側リソース令和8年度3.7億円から27倍増。公募要領は今後公表
SHIFT事業環境省77億円CO2削減計画策定(診断)、計画に基づく設備更新計画策定 上限100万円(補助率3/4)、設備更新 補助率1/3〜1/2、上限0.5〜5億円
Scope3企業間連携省CO2設備投資促進事業環境省37億円大企業の取引先(中小企業)の高効率ボイラー・生産設備等補助率1/2、上限15億円。代表企業の宣言が前提
商用車等の電動化促進事業環境省300億円EV・FCVトラック、バス、タクシー、GX建機車両価格と同格ディーゼル車の差額の一定割合。充電設備も一体補助
コールドチェーン脱フロン・脱炭素化推進事業環境省70億円食品製造・倉庫・小売の自然冷媒冷凍冷蔵機器補助率1/3〜1/2
業務用建築物の脱炭素改修加速化事業/ZEB化普及加速事業環境省115億円(うち67億円)事務所・店舗・工場等のZEB化、断熱・設備改修ZEB化補助率1/2〜2/3、改修は中小企業に高い補助率
ペロブスカイト太陽電池導入支援事業環境省280億円建物屋根・壁面・窓、インフラ空間へのフィルム型太陽電池民間事業者も対象。令和9年度に4倍増
循環資源の高効率・高度化設備導入等促進事業環境省103億円プラスチック・金属・繊維等のリサイクル設備補助率1/3〜1/2
高効率給湯器導入促進事業(給湯省エネ)経産省530億円個人住宅・賃貸住宅の給湯器機種別定額。工務店・設備事業者の営業ツールとして活用
断熱窓改修・脱炭素志向型住宅環境省1,480億円個人住宅の窓・ドア改修、新築GX志向型住宅施工事業者経由の申請。リフォーム・工務店の受注機会

省エネ・非化石転換補助金の4類型

中小企業のGX投資で最も使われる制度が、経産省の省エネ・非化石転換補助金です。令和9年度は2,108億円と、令和8年度当初840億円から2.5倍に増額されました。令和8年度公募では次の4類型で運用されており、令和9年度もこの枠組みが基本になると考えられます。

類型内容補助率(中小企業)特徴
(Ⅰ)工場・事業場型工場・事業場全体で行う先進設備の導入、機械設計を伴うオーダーメイド設備の導入先進枠2/3、一般枠1/2、中小企業投資促進枠1/2、サプライチェーン連携枠1/2設計費・設備費・工事費が対象。省エネ計算が必要
(Ⅱ)電化・脱炭素燃転型化石燃料から電気への転換、低炭素燃料への転換、水素対応設備1/2(設備費+工事費)炉・ボイラーの更新に伴う工事費も対象
(Ⅲ)設備単位型/GX設備単位型指定設備(業務用空調、変圧器、LED照明、冷凍冷蔵設備、給湯器、工作機械等15区分)の更新従来枠1/3、GX設備単位型トップ性能枠1/2(更新)、新設1/5事業所全体の省エネ計画が不要。中小企業に最も使いやすい
(Ⅳ)エネルギー需要最適化型EMS(エネルギーマネジメントシステム)の導入1/2設備更新と組み合わせて申請可能

令和8年度は3次公募(GX設備単位型のみ)が2026年9月に予定されています。令和9年度分は予算成立後の2027年4月以降に公募が始まる見込みで、当初予算に一本化されたことで、年度前半からの公募開始が現実的になります。

補助金の「自己点検」がGX補助金に与える影響

令和9年度概算要求では、国民から寄せられた約3万7千件の提案・意見を踏まえ、経産省の全補助金・基金について自己点検が実施されました。GX関連では次の見直しが明記されています。

対象見直し内容
クリーンエネルギー自動車導入促進補助金車両性能に加え、充電インフラ整備、バッテリー等の主要部品、重要鉱物の安定確保に向けたメーカーの取組を総合評価して車種ごとの補助額を決定。高額車種への補助抑制を継続
省エネ補助金全般効果検証の強化、政策効果の見込まれる事業への重点化。導入設備の実測データによる省エネ効果報告が求められる
生産性向上系補助金(新事業進出・ものづくり補助金等)足下の賃上げ実績を審査・評価する仕組みに見直し。GX投資を生産性向上補助金で行う場合も賃上げ実績が問われる

令和8年度当初・令和7年度補正との比較で読む増減の意味

GX関連予算の増減を事業横断で見ると、政策の重心が読み取れます。

方向事業増減読み方
大幅増省エネ・非化石転換の投資促進840億円→2,108億円(2.5倍)需要側の設備投資を最優先。中小企業の省エネ投資需要の掘り起こしが明記
大幅増SAF製造・供給体制構築100億円→700億円(7倍)2030年SAF10%義務化に向けた国産化投資
大幅増GXサプライチェーン構築497億円→1,134億円(2.3倍)蓄電池・ペロブスカイト・水電解装置の国内製造
大幅増ペロブスカイト太陽電池導入支援(環境省)70億円→280億円(4倍)2027年度からの社会実装フェーズ
大幅増分散型エネルギーリソース導入支援3.7億円→101億円(27倍)需要家側蓄電池・V2Hの本格支援
大幅増Scope3企業間連携(環境省)15億円→37億円(2.5倍)GX-ETS対象企業から取引先への波及を制度化
排出削減困難産業のプロセス転換417億円→881億円(2.1倍)鉄鋼・化学等の大型投資
水素価格差支援363億円→655億円(1.8倍)水素社会推進法に基づく15年支援の本格化
補正→当初CEV補助金、充電設備、高効率給湯器、断熱窓、脱炭素志向型住宅、商用車電動化補正計上から当初予算へ年度前半から公募可能に。予算切れリスクは残る
低炭素水素等拠点整備415億円→275億円拠点選定の進捗に合わせた執行
脱炭素電源地域貢献型投資促進400億円→260億円執行状況に応じた調整
GXディープテック・スタートアップ支援185億円→100億円既存基金残高との調整
GX推進機構出資金200億円→70億円R7補正450億円で資本を積んだため

今後のスケジュール

時期プロセス事業者側の動き
2026年8月末各省庁が概算要求を提出要求内容から翌年度の投資計画を検討
2026年9月省エネ補助金 令和8年度3次公募(GX設備単位型)年内に設備更新を行うなら最後の枠
2026年9月〜12月財務省査定、政府内調整予算額は圧縮される可能性あり
2026年12月末令和9年度予算案の閣議決定事業ごとの確定額が判明
2027年1月〜3月通常国会で予算審議・成立公募要領の公表に向けた準備
2027年4月以降令和9年度事業の公募開始当初予算化により早期公募が見込まれる
2027年度GX-ETS最初の排出枠割当大企業のScope3要請が本格化
2028年度化石燃料賦課金の導入エネルギーコスト上昇が顕在化

中小企業がGX補助金を活用するための3つの視点

省エネ補助金は「設備単位型」から入る

事業所全体の省エネ計算が不要な設備単位型は、業務用空調・LED・変圧器・冷凍冷蔵設備など汎用設備の更新で使えます。GX設備単位型トップ性能枠なら補助率1/2で、令和9年度の2,108億円への増額により採択枠の拡大が見込まれます。まず設備単位型で実績を作り、次の投資で工場・事業場型の先進枠(2/3)を狙う順番が現実的です。

取引先の大企業が「代表企業」になる制度を押さえる

環境省のScope3企業間連携事業は、GX-ETSの対象となる大企業が代表企業として宣言し、取引先である中小企業の省CO2設備投資を補助率1/2・上限15億円で支援する構造です。取引先からCO2排出量の報告や削減を求められている企業は、この制度の連携企業になれる可能性があります。令和9年度は予算が2.5倍に増えており、代表企業側にも制度を提案する価値があります。

補正予算待ちの投資サイクルを当初予算型に切り替える

これまでGX補助金の多くは年末の補正予算で措置され、翌年3月以降に公募される流れでした。令和9年度からは当初予算に一本化されるため、4月以降の早い時期に公募が始まる可能性があります。設備更新の時期を「補正が出てから」ではなく「年度当初の公募に合わせる」形に組み替えることで、採択率の高い1次公募を狙えます。

まとめ

令和9年度概算要求のGX関連予算は、経産省GX推進対策費1兆2,594億円、環境省GX推進対策費2,750億円の合計1兆5,344億円で、令和8年度当初の2.3倍です。省エネ・非化石転換補助金2,108億円、CEV補助金1,100億円、断熱窓改修980億円、SAF700億円、水素価格差支援655億円、商用車電動化300億円、ペロブスカイト280億円が主要事業となります。

中小企業にとって直接的な機会は、省エネ補助金の設備単位型・工場事業場型、SHIFT事業、Scope3企業間連携、商用車電動化、コールドチェーン脱フロン化、ZEB化補助です。当初予算への一本化で公募時期が前倒しになる可能性があるため、2027年度の設備投資計画は年度当初の公募を前提に組み立てることが重要です。

出典:経済産業省「令和9年度 経済産業省関係 概算要求等概要」(2026年8月31日)、環境省「令和9年度(2027年度)エネルギー対策特別会計概算要求 全体概要」(2026年8月28日)、資源エネルギー庁「令和7年度補正予算における省エネ支援パッケージ」